Para contemplar os diversos setores envolvidos na implementação do Complexo Industrial e Portuário do Pecém (CIPP), estão organizados os núcleos do Pacto pelo Pecém. Os debates são realizados de forma independente, porém integrando-se em diversos momentos a fim de compartilharem suas visões particulares. Os núcleos são: Poder Público Municipal, Estadual e Federal; setor produtivo (empresários); Sociedade civil organizada; Movimentos sociais e Academia e instituições formadoras.